Несколько графиков, каждый в своих координатных осях

Несколько графиков, каждый в своих координатных осях:

set terminal wxt 0 persist
plot x    # или plot 'data1.dat'

set terminal wxt 1 persist
plot x**2 # или plot 'data2.dat'

Если нужно анализировать графики последовательно, то достаточно одного окна, где очередной график будет появляться по нажатию "Enter":

plot x
pause -1  # пауза до нажатия "Enter"
plot x**2